1、超濾膜可以截留細菌，但不可以殺死細菌，截留率再好的超濾膜也不能長期保證干凈區不長一個細菌，有細菌就有可能繁殖。直接影響到過濾水質，因此，必須對周圍環境及過濾系統進行定期滅菌，滅菌的操作周期因供給原水的水質情況而定，對于城市普通自來水而言，夏季7-10天，冬季30-40天，春秋季20-30天。地表水作為供給水源時，滅菌周期更短。滅菌藥品可用次氯酸鈉或過氧化氫水溶液。

2、在使用前，應檢查超濾膜中不含有任何殺菌劑。由于每根超濾組件在出廠前加入保護液，使用前要沖洗組件中的保護液，沖洗時，系統的產水排放閥均應全部打開。